Jenoptik hat als integrierter Optoelektronik-Konzern seit 1. Januar 2008 eine neue Organisationsstruktur: Das gesamte operative Geschäft wurde in den fünf Sparten Optische Systeme, Laser & Materialbearbeitung, Industrielle Messtechnik, Verkehrssicherheit sowie Verteidigung & Zivile Systeme zusammengefasst. Umfassendes Optoelektronik-Know-how ist die Basis des Laser- und Optik-Geschäftes und ermöglicht die Systemgeschäfte in den drei anderen Sparten.

Zu den Kunden weltweit gehören vor allem Unternehmen der globalen Halbleiter- und Halbleiterausrüstungsindustrie, der Automobil- und Automobilzulieferindustrie, der Medizintechnik, der Sicherheits- und Wehrtechnik, der Luft- und Raumfahrtindustrie, Technologieunternehmen sowie die öffentliche Hand. Die börsennotierte JENOPTIK AG ist selbst nicht operativ tätig.

Die fünf Sparten gliedern sich in die Segmente Laser & Optische Systeme, Messtechnik und Verteidigung & Zivile Systeme und entsprechen damit der neuen Segmentberichterstattung des Jenoptik-Konzerns, die seit dem 1. Quartal 2008 greift.